
HIVはゲノムをヒトDNAに組み込み、長寿命の免疫細胞内に潜伏し続ける。抗ウイルス療法で血液中の検出可能なウイルスが抑制されても、少数の感染細胞が数年持続し、時に「クローン」として増殖するため、ウイルスリザーバーの除去が困難となる。
本プロジェクトでは、単一細胞技術を用いてHIV感染免疫細胞を高解像度でプロファイリングします。細胞単位での遺伝子発現測定により、HIV活性に関連する免疫細胞の状態を特定し、特にウイルス統合後の感染細胞と非感染細胞の差異を解明することを目指します。
トランスクリプトーム解析とウイルス組み込み部位を特定する手法を組み合わせることで、組み込みと宿主遺伝子調節がHIV-1感染細胞クローンの安定性・拡大にどのように寄与するかを解明します。これらの知見は、持続的なHIV寛解または治癒に向けた重要なステップであるリザーバーの制御・低減に向けた将来戦略の立案に寄与する可能性があります。